MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 93958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015564	CAG	2	6	244792	244797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917910
5002	NC_015564	CGC	3	9	244819	244827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917910
5003	NC_015564	GCC	2	6	244856	244861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917910
5004	NC_015564	AGT	2	6	244878	244883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917910
5005	NC_015564	GAT	3	9	244918	244926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917910
5006	NC_015564	GAC	2	6	245026	245031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917910
5007	NC_015564	ACA	2	6	245037	245042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917910
5008	NC_015564	CCG	2	6	245051	245056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917910
5009	NC_015564	GAG	2	6	245065	245070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917910
5010	NC_015564	TTG	2	6	245090	245095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917910
5011	NC_015564	GAA	2	6	245122	245127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917910
5012	NC_015564	AGA	2	6	245151	245156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917910
5013	NC_015564	ACG	2	6	245168	245173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917910
5014	NC_015564	CAA	2	6	245181	245186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917910
5015	NC_015564	CGC	3	9	245200	245208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917910
5016	NC_015564	AGG	2	6	245315	245320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917910
5017	NC_015564	GGCT	2	8	245372	245379	0 %	25 %	50 %	25 %	333917910
5018	NC_015564	CCG	2	6	245393	245398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917910
5019	NC_015564	GCC	2	6	245434	245439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917910
5020	NC_015564	GCC	2	6	245516	245521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917910
5021	NC_015564	CG	3	6	246000	246005	0 %	0 %	50 %	50 %	333917911
5022	NC_015564	GC	3	6	246025	246030	0 %	0 %	50 %	50 %	333917911
5023	NC_015564	CTG	2	6	246075	246080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917911
5024	NC_015564	CGA	2	6	246086	246091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917911
5025	NC_015564	TCA	2	6	246121	246126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917911
5026	NC_015564	CGG	2	6	246128	246133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917911
5027	NC_015564	GCC	2	6	246282	246287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917911
5028	NC_015564	CTG	2	6	246398	246403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917911
5029	NC_015564	GT	3	6	246409	246414	0 %	50 %	50 %	0 %	333917911
5030	NC_015564	GGTC	2	8	246470	246477	0 %	25 %	50 %	25 %	333917911
5031	NC_015564	ATG	2	6	246481	246486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917911
5032	NC_015564	GATC	2	8	246560	246567	25 %	25 %	25 %	25 %	333917911
5033	NC_015564	TGT	2	6	246593	246598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917911
5034	NC_015564	TTG	2	6	246649	246654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917911
5035	NC_015564	CGG	2	6	246754	246759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917911
5036	NC_015564	TCA	2	6	246763	246768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917911
5037	NC_015564	CGC	2	6	246797	246802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917911
5038	NC_015564	GCG	2	6	246916	246921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917911
5039	NC_015564	TG	3	6	246941	246946	0 %	50 %	50 %	0 %	333917911
5040	NC_015564	GAT	2	6	246960	246965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917911
5041	NC_015564	TGA	2	6	247055	247060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917911
5042	NC_015564	TCAGT	2	10	247127	247136	20 %	40 %	20 %	20 %	333917911
5043	NC_015564	CGC	2	6	247191	247196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917911
5044	NC_015564	GC	3	6	247214	247219	0 %	0 %	50 %	50 %	333917911
5045	NC_015564	CATC	2	8	247220	247227	25 %	25 %	0 %	50 %	333917911
5046	NC_015564	TGA	2	6	247238	247243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917911
5047	NC_015564	ACG	2	6	247264	247269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917911
5048	NC_015564	TTC	2	6	247315	247320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917911
5049	NC_015564	TTC	2	6	247356	247361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917911
5050	NC_015564	CGT	2	6	247391	247396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917911
5051	NC_015564	GAT	2	6	247416	247421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917911
5052	NC_015564	CGAAAT	2	12	247430	247441	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333917911
5053	NC_015564	CCG	2	6	247512	247517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917911
5054	NC_015564	GGGCT	2	10	247523	247532	0 %	20 %	60 %	20 %	333917911
5055	NC_015564	CAC	2	6	247579	247584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917911
5056	NC_015564	CCGGTA	2	12	247662	247673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333917911
5057	NC_015564	GCG	2	6	247750	247755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917911
5058	NC_015564	CAA	2	6	247775	247780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917911
5059	NC_015564	GTAA	2	8	247805	247812	50 %	25 %	25 %	0 %	333917911
5060	NC_015564	GC	3	6	247935	247940	0 %	0 %	50 %	50 %	333917911
5061	NC_015564	CGG	2	6	247955	247960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917911
5062	NC_015564	GCGTCG	2	12	247994	248005	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333917911
5063	NC_015564	GCA	2	6	248158	248163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917912
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5065	NC_015564	CG	3	6	248188	248193	0 %	0 %	50 %	50 %	333917912
5066	NC_015564	CGCT	2	8	248199	248206	0 %	25 %	25 %	50 %	333917912
5067	NC_015564	CGA	2	6	248239	248244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917912
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5069	NC_015564	TCGC	2	8	248303	248310	0 %	25 %	25 %	50 %	333917912
5070	NC_015564	GTG	2	6	248336	248341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917912
5071	NC_015564	ACG	2	6	248342	248347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917912
5072	NC_015564	AGC	2	6	248430	248435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917912
5073	NC_015564	CGAG	2	8	248467	248474	25 %	0 %	50 %	25 %	333917912
5074	NC_015564	GC	4	8	248487	248494	0 %	0 %	50 %	50 %	333917912
5075	NC_015564	CAG	2	6	248555	248560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917912
5076	NC_015564	CGA	2	6	248569	248574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917912
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5081	NC_015564	GAA	2	6	249071	249076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917912
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5086	NC_015564	GC	3	6	249301	249306	0 %	0 %	50 %	50 %	333917912
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5089	NC_015564	TCG	2	6	249637	249642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917913
5090	NC_015564	GTT	3	9	249669	249677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917913
5091	NC_015564	GCC	2	6	249720	249725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917913
5092	NC_015564	CGC	2	6	249739	249744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917913
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5102	NC_015564	TGC	2	6	250447	250452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917913
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5104	NC_015564	GTC	2	6	250800	250805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917913
5105	NC_015564	GGTC	2	8	250867	250874	0 %	25 %	50 %	25 %	333917914
5106	NC_015564	TGCG	2	8	250881	250888	0 %	25 %	50 %	25 %	333917914
5107	NC_015564	CTC	2	6	250889	250894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917914
5108	NC_015564	GGAAC	2	10	250897	250906	40 %	0 %	40 %	20 %	333917914
5109	NC_015564	CTT	2	6	250927	250932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917914
5110	NC_015564	CG	3	6	250939	250944	0 %	0 %	50 %	50 %	333917914
5111	NC_015564	ACG	2	6	250955	250960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917914
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5113	NC_015564	G	6	6	251053	251058	0 %	0 %	100 %	0 %	333917914
5114	NC_015564	CGG	3	9	251091	251099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917914
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5118	NC_015564	ACG	2	6	251262	251267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917914
5119	NC_015564	CTCA	2	8	251345	251352	25 %	25 %	0 %	50 %	333917914
5120	NC_015564	CG	3	6	251357	251362	0 %	0 %	50 %	50 %	333917914
5121	NC_015564	CGA	2	6	251368	251373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917914
5122	NC_015564	CCG	2	6	251400	251405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917914
5123	NC_015564	ACGT	2	8	251426	251433	25 %	25 %	25 %	25 %	333917914
5124	NC_015564	GGCG	2	8	251464	251471	0 %	0 %	75 %	25 %	333917914
5125	NC_015564	TCG	2	6	251475	251480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917914
5126	NC_015564	GT	3	6	251572	251577	0 %	50 %	50 %	0 %	333917914
5127	NC_015564	CGT	2	6	251587	251592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917914
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5142	NC_015564	GTC	2	6	252259	252264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917915
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5153	NC_015564	CGA	2	6	252873	252878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917915
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5230	NC_015564	GCG	2	6	257267	257272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917920
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5239	NC_015564	TCT	2	6	258117	258122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917922
5240	NC_015564	CGA	2	6	258132	258137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917922
5241	NC_015564	GAG	2	6	258292	258297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917922
5242	NC_015564	GACC	2	8	258303	258310	25 %	0 %	25 %	50 %	333917922
5243	NC_015564	CGG	2	6	258335	258340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917922
5244	NC_015564	TGA	2	6	258362	258367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917922
5245	NC_015564	CGA	2	6	258462	258467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917922
5246	NC_015564	TCC	2	6	258494	258499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917922
5247	NC_015564	CGC	2	6	258517	258522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917922
5248	NC_015564	ATG	2	6	258541	258546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917922
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5250	NC_015564	GCA	2	6	258570	258575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917922
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5254	NC_015564	TGG	2	6	259133	259138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917923
5255	NC_015564	CGC	2	6	259150	259155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917923
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5263	NC_015564	CGG	2	6	259458	259463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917923
5264	NC_015564	CCT	2	6	259486	259491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917923
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5270	NC_015564	ACG	2	6	259860	259865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917924
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5272	NC_015564	CTG	2	6	259911	259916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917924
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5274	NC_015564	GTCG	2	8	259971	259978	0 %	25 %	50 %	25 %	333917924
5275	NC_015564	TGC	2	6	260014	260019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917924
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5341	NC_015564	AAGA	2	8	263920	263927	75 %	0 %	25 %	0 %	333917928
5342	NC_015564	TGA	2	6	263934	263939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917928
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5352	NC_015564	ACG	2	6	264574	264579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917929
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5354	NC_015564	GTT	2	6	264627	264632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917929
5355	NC_015564	ACGG	2	8	264898	264905	25 %	0 %	50 %	25 %	333917930
5356	NC_015564	CAG	2	6	264933	264938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917930
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5358	NC_015564	CGAT	2	8	265054	265061	25 %	25 %	25 %	25 %	333917930
5359	NC_015564	CACC	2	8	265082	265089	25 %	0 %	0 %	75 %	333917930
5360	NC_015564	GGCA	2	8	265093	265100	25 %	0 %	50 %	25 %	333917930
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5362	NC_015564	TCA	2	6	265147	265152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917930
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5364	NC_015564	CGA	2	6	265315	265320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917930
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5366	NC_015564	AGGGG	2	10	265376	265385	20 %	0 %	80 %	0 %	333917930
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5483	NC_015564	TCGGA	2	10	270952	270961	20 %	20 %	40 %	20 %	333917934
5484	NC_015564	ACG	2	6	271037	271042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917934
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5487	NC_015564	CCG	3	9	271262	271270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917934
5488	NC_015564	GCG	2	6	271305	271310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917934
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